Peran Stasiun Gambir akan digantikan oleh Stasiun Manggarai yang dipilih Pemerintah dalam hal ini Kementerian Perhubungan sebagai hub atau central statition di DKI Jakarta. Dengan begitu, Ka jarak jauh akan berhenti di sana.
Dengan menjadi hub, Stasiun Manggarai nantinya akan terintegrasi dengan Halte Transjakarta yang disambungkan oleh skybridge. Stasiun Manggarai dipulih menjadi pusat karena telah menjadi titik temu bagi moda transportasi berbasis rel, yaitu KRL commutet Jabodetabek dan Ka bandara.